瑜加行派是从无著，世亲这个系统下来的，重要的典据是《瑜伽师地论》。“瑜伽师”是汉译名，从藏译看，原名是“瑜伽行”，所以一般称这派为瑜伽行派。此派是从世亲传承下来的，世亲的学说规模大，方面广，但在形成瑜伽行派的发展过程中，却始终是以唯识说为主导的。在唯识学说发展中有两个系统；一者是唯识古学；二者是唯识今学。
    一、唯识古学
    唯识古学比较偏重於保守，注意保持世亲学的原来精神，甚至在文字上也尽量保持原貌。唯识古学的代表人物先有难陀，后有安慧。
    难陀唯识说的重要根据是世亲的几部论：《二十唯识论》、《三十唯识论》等，甚至可以追溯到《摄大乘论释》、《辨中边论释》中关於唯识的思想。以陀把上述各书的唯说贯穿起来，并加以发挥。因此，要了解难陀的主张，应先读其思想渊源的《摄大乘论》。《摄大乘论》中曾提出了三点成立唯识的理由：(一)由唯识无义。“义”即境，就是说，心法中只有识而无境。心法的对象都是无体的；不实在的，所以成立了唯识。(二)由于有见相二。虽无实境，但它毕竟有个来源，它的来源仍然是识。其原因是因心与境是以“见”“相”关系统一在一种识里的，如眼识属于“见”，所见的各种色训就是“相”，色识也统一在眼识中，成为一级，总的谓之眼识。因此，这也成立了唯识。(三)由种种相生起。前五识都各有自己的确定对象，如眼限於见色，耻根于闻声等，到第六识，范围就宽了，它可遍缘於十八界，但仍属于“相”的一边，所生起手足 种“相”，仍在识的范围内，所以也成立了唯识。
    《摄大乘论》成立唯识的三个理由完全根据它把识总起来讲。诸认总的来说，凡有十一类，即身识、身者识、爱者识、就受识、正受识、世只、数识、处识、言说识、自他差别识、善恶两道生死识。这十一类决摄一切识。如说眼识，就可归于身识，色识，归于应受识等。这十一类识在观行识，看具体情况来配合，哪一类的识属哪一识的见或相，并不是固定的。难陀根据《摄大乘论》的说法有了发展，他把见相固定了，把八识分开来讲。说每种识教个别的有其见相，如眼与色相对，耳与声相对等，分工明确，不相紊乱。就是说，每一种识生起都有两种作用，一是能取境，一是它转变成为所取的境。因此，见相固定在每一种训上，能取的就叫“见分”，所取的就叫“相分”，那么，按实言之，这二分都同为识的自体呢，还是各一分为识的自体？难陀认为，二分中见分为自体，见分是转变出来的，所以是不实在的虚象。如以三性区分，相分是虚像，属遍计所执性；见分因有分别作用，属于依他起性；只有到它转变成净的性质以后，即认识到相分是不实在的以后，那时所显现的才是圆成实。
    难陀以《摄大乘论》出发，首创见相二分说，同时又与种子说相联系而创种子新熏说。在他看来，见相分之转变，显现，是由于种子的功能，种子则由熏习而起。所谓熏习，就是前七识有了分别而留习气于第八识上，这些习气将士烛可以发生现行的，所以叫它种子。种子的来源就是熏习。难陀进而认为，种了既是由熏习来，熏非本有，而是现熏。人们把他这种说法称为新熏说。
    以陀的唯识说与世亲比较接近，虽然有所发展，但基本精神还是来自世亲。难陀的发展是他明确地指出相分是无体的，见分也无其地相。因此，后世称它的学说为“无相唯识说”。
    唯识古学的代表，难陀之后还有安慧。安慧基本上继承了难陀的思想，同时吸收了陈那之所长，把二分说、三分说同《摄大乘论》、《辨中边论》中的唯识说事例一起。虽然他的说法还是三分说，但他用《辨中边论》开宗明义第一颂的意思，认为识法分别只是“虚妄分别”。在此分别上的见相二分即“二取”，是遍社所执性，都是不实在的，所以谓之“二取无”。只有自证那一分才是实在的，属於依他起的性质。所以以心分来说，三分说反而成为一分说了。
    安慧产於种子瓣熏的说法，与难陀差不多。由於他这种唯识说，主张相分不实在，甚至连见分也是不实的，亦无行相，所以也属“无相唯识说”。
    二、唯识今学
    唯识今学，态度比较自由，进取，在不丧失无著、世亲学说基本精神的范围内，对其学说，大加发挥，在文字上也做了一些改动。这比难陀，安慧等的原派来说，是一个新派，所以称之为唯识今学。
    唯识今学的代表人物当推陈那和护法。陈那是世亲的门下。他的著作中有许多讲到唯识的地方，特别是《观所缘论》就是成立 唯识无境的著作。陈那说的“所缘”就是境，此境不是在心外。陈那认为，能够称得上“所缘”的应具备两个条件：(一)“有实体，令能缘识，长彼而生。”就是说，所缘(境)必须是实体性的事物，还必须能够引起能缘(心)攀缘而生。(二)“能缘识，带彼相卢。”就是说，在能缘识生起以后的分别中，要有它的行相。这个行相虽然似境，但却是从心中生出来的，如镜显影，但产生影的功能却在于镜子本身。考究这两个条件，境不会是在心外的实物，而在心内，是心的一部分(心的相分)。由此看来，陈那也是主张唯识说的。不过，他的说法有其特点：相分引起见分，见分所得的行相与相分一模一样，因此这个相分(所缘)也是内境。这样，第一、相分是有实体的，实在的；第二、见分也有其行相；这种唯识说一般称之为“有相唯识说”。
    陈那认为量的性质是自己了解自己，这也叫“自证”。这样，从心分来说，在见分相分之外，他又加量果一分也叫“自证分”，而组成三分说。
    唯识今学的另一家是护法。护法的唯识学说比较特殊的看法有下列几点：
   (一)、他对世亲《三十唯识颂》作了改动，中间修改了唯识性的一个颂。他将三十颂分为三大段，开始十二四颂是一段，讲唯识相；中间一颂是一段，讲唯识性；最后五颂是一段，讲唯识位。
   (二)、关于心分，护法主张四分说。他认为“见”、“相”二分是一重关系，对一专的全体来说这是比较外围的一部分。到了“自证”，就属于心的核心部份，属于内缘，而内缘复有能所，能，就是“证自证”，所，就是“自证”。这又是一重关系。由这两种关系就构成了四分说。唯识说发展到四分说算是最完备的了。
   (三)、关于种了说，护法调和难陀的新熏说和护月的本有说，认为种子既有本有，也有新熏，在发生作用时，两者均发生力量。
   (四)、关于唯识的性质问题，一般认为唯识的含义是：一切法说到究，竟性质上属于识的一类，以识为性，所以是唯识。护法则认为一切法只要不离识就可以，不单独脱离识而存在就是唯识。